Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms