Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H5

SNCAIP, Synphilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAIPQ9Y6H5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNCAIPQ9Y6H5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNCAIPQ9Y6H5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNCAIPQ9Y6H5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNCAIPQ9Y6H5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNCAIPQ9Y6H5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNCAIPQ9Y6H5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SNCAIPQ9Y6H5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SNCAIPQ9Y6H5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SNCAIPQ9Y6H5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SNCAIPQ9Y6H5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SNCAIPQ9Y6H5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNCAIPQ9Y6H5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNCAIPQ9Y6H5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNCAIPQ9Y6H5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNCAIPQ9Y6H5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNCAIPQ9Y6H5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNCAIPQ9Y6H5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNCAIPQ9Y6H5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNCAIPQ9Y6H5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNCAIPQ9Y6H5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNCAIPQ9Y6H5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNCAIPQ9Y6H5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNCAIPQ9Y6H5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNCAIPQ9Y6H5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNCAIPQ9Y6H5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNCAIPQ9Y6H5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNCAIPQ9Y6H5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNCAIPQ9Y6H5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SNCAIPQ9Y6H5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
SNCAIPQ9Y6H5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SNCAIPQ9Y6H5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SNCAIPQ9Y6H5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SNCAIPQ9Y6H5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNCAIPQ9Y6H5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SNCAIPQ9Y6H5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SNCAIPQ9Y6H5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SNCAIPQ9Y6H5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNCAIPQ9Y6H5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SNCAIPQ9Y6H5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNCAIPQ9Y6H5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SNCAIPQ9Y6H5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNCAIPQ9Y6H5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNCAIPQ9Y6H5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNCAIPQ9Y6H5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNCAIPQ9Y6H5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNCAIPQ9Y6H5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SNCAIPQ9Y6H5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNCAIPQ9Y6H5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNCAIPQ9Y6H5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNCAIPQ9Y6H5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNCAIPQ9Y6H5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNCAIPQ9Y6H5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNCAIPQ9Y6H5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SNCAIPQ9Y6H5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SNCAIPQ9Y6H5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SNCAIPQ9Y6H5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SNCAIPQ9Y6H5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SNCAIPQ9Y6H5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SNCAIPQ9Y6H5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNCAIPQ9Y6H5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNCAIPQ9Y6H5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNCAIPQ9Y6H5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNCAIPQ9Y6H5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNCAIPQ9Y6H5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNCAIPQ9Y6H5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNCAIPQ9Y6H5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNCAIPQ9Y6H5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNCAIPQ9Y6H5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNCAIPQ9Y6H5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNCAIPQ9Y6H5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SNCAIPQ9Y6H5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNCAIPQ9Y6H5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SNCAIPQ9Y6H5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNCAIPQ9Y6H5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNCAIPQ9Y6H5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNCAIPQ9Y6H5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNCAIPQ9Y6H5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNCAIPQ9Y6H5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNCAIPQ9Y6H5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SNCAIPQ9Y6H5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SNCAIPQ9Y6H5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNCAIPQ9Y6H5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNCAIPQ9Y6H5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNCAIPQ9Y6H5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNCAIPQ9Y6H5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNCAIPQ9Y6H5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNCAIPQ9Y6H5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNCAIPQ9Y6H5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNCAIPQ9Y6H5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNCAIPQ9Y6H5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNCAIPQ9Y6H5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNCAIPQ9Y6H5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNCAIPQ9Y6H5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNCAIPQ9Y6H5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNCAIPQ9Y6H5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNCAIPQ9Y6H5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNCAIPQ9Y6H5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SNCAIPQ9Y6H5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNCAIPQ9Y6H5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms