Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNPO3Q9Y5L0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms