Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V0

C15orf41, Uncharacterized protein C15orf41, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf41Q9Y2V0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C15orf41Q9Y2V0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C15orf41Q9Y2V0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C15orf41Q9Y2V0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C15orf41Q9Y2V0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C15orf41Q9Y2V0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C15orf41Q9Y2V0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C15orf41Q9Y2V0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C15orf41Q9Y2V0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C15orf41Q9Y2V0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C15orf41Q9Y2V0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C15orf41Q9Y2V0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C15orf41Q9Y2V0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C15orf41Q9Y2V0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C15orf41Q9Y2V0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C15orf41Q9Y2V0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C15orf41Q9Y2V0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C15orf41Q9Y2V0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
C15orf41Q9Y2V0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C15orf41Q9Y2V0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C15orf41Q9Y2V0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
C15orf41Q9Y2V0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C15orf41Q9Y2V0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C15orf41Q9Y2V0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C15orf41Q9Y2V0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C15orf41Q9Y2V0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C15orf41Q9Y2V0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C15orf41Q9Y2V0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C15orf41Q9Y2V0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C15orf41Q9Y2V0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C15orf41Q9Y2V0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
C15orf41Q9Y2V0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C15orf41Q9Y2V0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C15orf41Q9Y2V0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C15orf41Q9Y2V0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms