Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3M1Q9Y2T2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms