Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAN1Q9Y2M0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms