Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L9

LRCH1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH1Q9Y2L9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRCH1Q9Y2L9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRCH1Q9Y2L9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRCH1Q9Y2L9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRCH1Q9Y2L9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRCH1Q9Y2L9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRCH1Q9Y2L9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRCH1Q9Y2L9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRCH1Q9Y2L9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH1Q9Y2L9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH1Q9Y2L9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH1Q9Y2L9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH1Q9Y2L9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH1Q9Y2L9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH1Q9Y2L9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH1Q9Y2L9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH1Q9Y2L9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH1Q9Y2L9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH1Q9Y2L9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH1Q9Y2L9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH1Q9Y2L9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH1Q9Y2L9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH1Q9Y2L9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH1Q9Y2L9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH1Q9Y2L9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH1Q9Y2L9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH1Q9Y2L9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH1Q9Y2L9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms