Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K2

SIK3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK3Q9Y2K2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SIK3Q9Y2K2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms