Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHKBQ9Y259 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms