Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RCE1Q9Y256 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms