Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQR0

SCML2, Sex comb on midleg-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML2Q9UQR0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SCML2Q9UQR0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCML2Q9UQR0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCML2Q9UQR0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCML2Q9UQR0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SCML2Q9UQR0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCML2Q9UQR0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCML2Q9UQR0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCML2Q9UQR0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCML2Q9UQR0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCML2Q9UQR0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCML2Q9UQR0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SCML2Q9UQR0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCML2Q9UQR0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCML2Q9UQR0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCML2Q9UQR0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCML2Q9UQR0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCML2Q9UQR0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCML2Q9UQR0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms