Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ53

MGAT4B, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase B, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4BQ9UQ53 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MGAT4BQ9UQ53 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGAT4BQ9UQ53 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGAT4BQ9UQ53 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGAT4BQ9UQ53 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGAT4BQ9UQ53 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGAT4BQ9UQ53 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGAT4BQ9UQ53 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGAT4BQ9UQ53 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGAT4BQ9UQ53 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGAT4BQ9UQ53 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MGAT4BQ9UQ53 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MGAT4BQ9UQ53 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MGAT4BQ9UQ53 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MGAT4BQ9UQ53 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MGAT4BQ9UQ53 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MGAT4BQ9UQ53 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MGAT4BQ9UQ53 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MGAT4BQ9UQ53 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MGAT4BQ9UQ53 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MGAT4BQ9UQ53 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MGAT4BQ9UQ53 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MGAT4BQ9UQ53 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MGAT4BQ9UQ53 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MGAT4BQ9UQ53 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MGAT4BQ9UQ53 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MGAT4BQ9UQ53 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MGAT4BQ9UQ53 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MGAT4BQ9UQ53 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MGAT4BQ9UQ53 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MGAT4BQ9UQ53 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MGAT4BQ9UQ53 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MGAT4BQ9UQ53 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MGAT4BQ9UQ53 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MGAT4BQ9UQ53 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MGAT4BQ9UQ53 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MGAT4BQ9UQ53 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MGAT4BQ9UQ53 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MGAT4BQ9UQ53 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MGAT4BQ9UQ53 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MGAT4BQ9UQ53 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MGAT4BQ9UQ53 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MGAT4BQ9UQ53 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MGAT4BQ9UQ53 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MGAT4BQ9UQ53 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MGAT4BQ9UQ53 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MGAT4BQ9UQ53 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MGAT4BQ9UQ53 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MGAT4BQ9UQ53 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MGAT4BQ9UQ53 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MGAT4BQ9UQ53 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms