Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SHOC2Q9UQ13 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
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