Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNRC6BQ9UPQ9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNRC6BQ9UPQ9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNRC6BQ9UPQ9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNRC6BQ9UPQ9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TNRC6BQ9UPQ9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNRC6BQ9UPQ9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNRC6BQ9UPQ9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNRC6BQ9UPQ9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNRC6BQ9UPQ9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TNRC6BQ9UPQ9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNRC6BQ9UPQ9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNRC6BQ9UPQ9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNRC6BQ9UPQ9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNRC6BQ9UPQ9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TNRC6BQ9UPQ9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNRC6BQ9UPQ9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNRC6BQ9UPQ9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms