Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TRIM35Q9UPQ4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TRIM35Q9UPQ4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TRIM35Q9UPQ4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TRIM35Q9UPQ4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TRIM35Q9UPQ4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TRIM35Q9UPQ4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TRIM35Q9UPQ4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TRIM35Q9UPQ4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TRIM35Q9UPQ4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TRIM35Q9UPQ4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TRIM35Q9UPQ4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TRIM35Q9UPQ4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TRIM35Q9UPQ4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TRIM35Q9UPQ4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TRIM35Q9UPQ4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TRIM35Q9UPQ4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TRIM35Q9UPQ4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TRIM35Q9UPQ4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TRIM35Q9UPQ4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TRIM35Q9UPQ4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
TRIM35Q9UPQ4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TRIM35Q9UPQ4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TRIM35Q9UPQ4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TRIM35Q9UPQ4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TRIM35Q9UPQ4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TRIM35Q9UPQ4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TRIM35Q9UPQ4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
TRIM35Q9UPQ4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TRIM35Q9UPQ4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TRIM35Q9UPQ4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TRIM35Q9UPQ4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TRIM35Q9UPQ4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TRIM35Q9UPQ4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TRIM35Q9UPQ4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TRIM35Q9UPQ4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TRIM35Q9UPQ4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TRIM35Q9UPQ4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
TRIM35Q9UPQ4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRIM35Q9UPQ4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRIM35Q9UPQ4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRIM35Q9UPQ4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRIM35Q9UPQ4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
TRIM35Q9UPQ4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRIM35Q9UPQ4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRIM35Q9UPQ4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRIM35Q9UPQ4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRIM35Q9UPQ4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRIM35Q9UPQ4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRIM35Q9UPQ4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRIM35Q9UPQ4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRIM35Q9UPQ4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRIM35Q9UPQ4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRIM35Q9UPQ4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRIM35Q9UPQ4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRIM35Q9UPQ4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRIM35Q9UPQ4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRIM35Q9UPQ4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
TRIM35Q9UPQ4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRIM35Q9UPQ4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRIM35Q9UPQ4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms