Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FZD1Q9UP38 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FZD1Q9UP38 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
FZD1Q9UP38 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FZD1Q9UP38 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FZD1Q9UP38 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FZD1Q9UP38 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FZD1Q9UP38 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FZD1Q9UP38 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FZD1Q9UP38 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FZD1Q9UP38 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FZD1Q9UP38 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FZD1Q9UP38 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FZD1Q9UP38 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FZD1Q9UP38 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
FZD1Q9UP38 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
FZD1Q9UP38 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
FZD1Q9UP38 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
FZD1Q9UP38 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
FZD1Q9UP38 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FZD1Q9UP38 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FZD1Q9UP38 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FZD1Q9UP38 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FZD1Q9UP38 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FZD1Q9UP38 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FZD1Q9UP38 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FZD1Q9UP38 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FZD1Q9UP38 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FZD1Q9UP38 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FZD1Q9UP38 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FZD1Q9UP38 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FZD1Q9UP38 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FZD1Q9UP38 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FZD1Q9UP38 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FZD1Q9UP38 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FZD1Q9UP38 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FZD1Q9UP38 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FZD1Q9UP38 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FZD1Q9UP38 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FZD1Q9UP38 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FZD1Q9UP38 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FZD1Q9UP38 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FZD1Q9UP38 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
FZD1Q9UP38 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FZD1Q9UP38 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FZD1Q9UP38 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FZD1Q9UP38 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FZD1Q9UP38 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FZD1Q9UP38 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FZD1Q9UP38 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FZD1Q9UP38 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FZD1Q9UP38 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FZD1Q9UP38 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FZD1Q9UP38 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FZD1Q9UP38 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FZD1Q9UP38 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FZD1Q9UP38 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FZD1Q9UP38 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FZD1Q9UP38 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FZD1Q9UP38 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FZD1Q9UP38 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FZD1Q9UP38 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FZD1Q9UP38 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FZD1Q9UP38 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FZD1Q9UP38 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FZD1Q9UP38 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FZD1Q9UP38 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FZD1Q9UP38 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FZD1Q9UP38 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FZD1Q9UP38 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FZD1Q9UP38 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FZD1Q9UP38 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FZD1Q9UP38 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FZD1Q9UP38 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FZD1Q9UP38 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FZD1Q9UP38 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FZD1Q9UP38 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FZD1Q9UP38 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FZD1Q9UP38 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FZD1Q9UP38 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FZD1Q9UP38 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FZD1Q9UP38 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FZD1Q9UP38 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FZD1Q9UP38 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FZD1Q9UP38 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FZD1Q9UP38 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FZD1Q9UP38 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FZD1Q9UP38 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FZD1Q9UP38 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FZD1Q9UP38 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FZD1Q9UP38 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FZD1Q9UP38 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FZD1Q9UP38 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FZD1Q9UP38 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FZD1Q9UP38 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FZD1Q9UP38 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FZD1Q9UP38 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FZD1Q9UP38 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FZD1Q9UP38 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FZD1Q9UP38 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1671.6 ms