Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHTF1Q9UMS5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PHTF1Q9UMS5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms