Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS4

PRPF19, Pre-mRNA-processing factor 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF19Q9UMS4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF19Q9UMS4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms