Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULZ9

MMP17, Matrix metalloproteinase-17, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17Q9ULZ9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP17Q9ULZ9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms