Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL4

PLXNB3, Plexin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB3Q9ULL4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLXNB3Q9ULL4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLXNB3Q9ULL4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms