Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD8

KCNH3, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH3Q9ULD8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
KCNH3Q9ULD8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms