Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ1

LAMP5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP5Q9UJQ1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMP5Q9UJQ1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMP5Q9UJQ1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMP5Q9UJQ1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMP5Q9UJQ1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMP5Q9UJQ1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMP5Q9UJQ1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMP5Q9UJQ1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMP5Q9UJQ1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMP5Q9UJQ1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMP5Q9UJQ1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMP5Q9UJQ1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMP5Q9UJQ1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMP5Q9UJQ1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMP5Q9UJQ1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMP5Q9UJQ1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMP5Q9UJQ1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMP5Q9UJQ1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
LAMP5Q9UJQ1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms