Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PUF60Q9UHX1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms