Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED13Q9UHV7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms