Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI5

SLC7A8, Large neutral amino acids transporter small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A8Q9UHI5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC7A8Q9UHI5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A8Q9UHI5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC7A8Q9UHI5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC7A8Q9UHI5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC7A8Q9UHI5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms