Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CLIP2Q9UDT6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIP2Q9UDT6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIP2Q9UDT6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIP2Q9UDT6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIP2Q9UDT6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIP2Q9UDT6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIP2Q9UDT6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIP2Q9UDT6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIP2Q9UDT6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIP2Q9UDT6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIP2Q9UDT6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIP2Q9UDT6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIP2Q9UDT6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIP2Q9UDT6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIP2Q9UDT6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIP2Q9UDT6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIP2Q9UDT6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIP2Q9UDT6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIP2Q9UDT6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIP2Q9UDT6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIP2Q9UDT6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIP2Q9UDT6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIP2Q9UDT6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIP2Q9UDT6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIP2Q9UDT6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIP2Q9UDT6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIP2Q9UDT6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLIP2Q9UDT6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLIP2Q9UDT6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLIP2Q9UDT6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLIP2Q9UDT6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLIP2Q9UDT6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLIP2Q9UDT6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CLIP2Q9UDT6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLIP2Q9UDT6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLIP2Q9UDT6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLIP2Q9UDT6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLIP2Q9UDT6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CLIP2Q9UDT6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLIP2Q9UDT6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLIP2Q9UDT6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLIP2Q9UDT6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLIP2Q9UDT6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLIP2Q9UDT6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CLIP2Q9UDT6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CLIP2Q9UDT6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLIP2Q9UDT6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CLIP2Q9UDT6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIP2Q9UDT6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIP2Q9UDT6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIP2Q9UDT6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIP2Q9UDT6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIP2Q9UDT6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIP2Q9UDT6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIP2Q9UDT6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLIP2Q9UDT6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLIP2Q9UDT6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLIP2Q9UDT6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLIP2Q9UDT6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLIP2Q9UDT6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLIP2Q9UDT6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLIP2Q9UDT6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLIP2Q9UDT6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLIP2Q9UDT6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLIP2Q9UDT6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLIP2Q9UDT6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLIP2Q9UDT6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms