Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU3

GHRL, Appetite-regulating hormone, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GHRLQ9UBU3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GHRLQ9UBU3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GHRLQ9UBU3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GHRLQ9UBU3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GHRLQ9UBU3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GHRLQ9UBU3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GHRLQ9UBU3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GHRLQ9UBU3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GHRLQ9UBU3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GHRLQ9UBU3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GHRLQ9UBU3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GHRLQ9UBU3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GHRLQ9UBU3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GHRLQ9UBU3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GHRLQ9UBU3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GHRLQ9UBU3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GHRLQ9UBU3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GHRLQ9UBU3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GHRLQ9UBU3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GHRLQ9UBU3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GHRLQ9UBU3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GHRLQ9UBU3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GHRLQ9UBU3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GHRLQ9UBU3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GHRLQ9UBU3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GHRLQ9UBU3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GHRLQ9UBU3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GHRLQ9UBU3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GHRLQ9UBU3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GHRLQ9UBU3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GHRLQ9UBU3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GHRLQ9UBU3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GHRLQ9UBU3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GHRLQ9UBU3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GHRLQ9UBU3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GHRLQ9UBU3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GHRLQ9UBU3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GHRLQ9UBU3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GHRLQ9UBU3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GHRLQ9UBU3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GHRLQ9UBU3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GHRLQ9UBU3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GHRLQ9UBU3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GHRLQ9UBU3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GHRLQ9UBU3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GHRLQ9UBU3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GHRLQ9UBU3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms