Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBH6

XPR1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPR1Q9UBH6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms