Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBA6

C6orf48, Protein G8, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48Q9UBA6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms