Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2Q2

FRMD4A, FERM domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRMD4AQ9P2Q2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FRMD4AQ9P2Q2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FRMD4AQ9P2Q2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FRMD4AQ9P2Q2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
FRMD4AQ9P2Q2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FRMD4AQ9P2Q2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FRMD4AQ9P2Q2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FRMD4AQ9P2Q2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FRMD4AQ9P2Q2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FRMD4AQ9P2Q2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FRMD4AQ9P2Q2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FRMD4AQ9P2Q2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FRMD4AQ9P2Q2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FRMD4AQ9P2Q2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMD4AQ9P2Q2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMD4AQ9P2Q2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMD4AQ9P2Q2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMD4AQ9P2Q2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMD4AQ9P2Q2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMD4AQ9P2Q2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMD4AQ9P2Q2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMD4AQ9P2Q2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMD4AQ9P2Q2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMD4AQ9P2Q2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMD4AQ9P2Q2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FRMD4AQ9P2Q2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FRMD4AQ9P2Q2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FRMD4AQ9P2Q2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FRMD4AQ9P2Q2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
FRMD4AQ9P2Q2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FRMD4AQ9P2Q2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FRMD4AQ9P2Q2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FRMD4AQ9P2Q2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FRMD4AQ9P2Q2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FRMD4AQ9P2Q2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FRMD4AQ9P2Q2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FRMD4AQ9P2Q2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
FRMD4AQ9P2Q2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FRMD4AQ9P2Q2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FRMD4AQ9P2Q2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FRMD4AQ9P2Q2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FRMD4AQ9P2Q2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FRMD4AQ9P2Q2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FRMD4AQ9P2Q2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FRMD4AQ9P2Q2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FRMD4AQ9P2Q2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FRMD4AQ9P2Q2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FRMD4AQ9P2Q2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FRMD4AQ9P2Q2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FRMD4AQ9P2Q2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FRMD4AQ9P2Q2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FRMD4AQ9P2Q2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FRMD4AQ9P2Q2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FRMD4AQ9P2Q2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FRMD4AQ9P2Q2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FRMD4AQ9P2Q2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FRMD4AQ9P2Q2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FRMD4AQ9P2Q2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms