Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms