Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMOD4Q9NZQ9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMOD4Q9NZQ9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMOD4Q9NZQ9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMOD4Q9NZQ9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMOD4Q9NZQ9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMOD4Q9NZQ9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMOD4Q9NZQ9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMOD4Q9NZQ9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMOD4Q9NZQ9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMOD4Q9NZQ9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMOD4Q9NZQ9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMOD4Q9NZQ9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMOD4Q9NZQ9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMOD4Q9NZQ9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMOD4Q9NZQ9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMOD4Q9NZQ9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMOD4Q9NZQ9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMOD4Q9NZQ9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMOD4Q9NZQ9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMOD4Q9NZQ9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMOD4Q9NZQ9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMOD4Q9NZQ9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMOD4Q9NZQ9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TMOD4Q9NZQ9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMOD4Q9NZQ9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMOD4Q9NZQ9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMOD4Q9NZQ9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TMOD4Q9NZQ9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMOD4Q9NZQ9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMOD4Q9NZQ9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMOD4Q9NZQ9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMOD4Q9NZQ9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TMOD4Q9NZQ9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMOD4Q9NZQ9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMOD4Q9NZQ9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMOD4Q9NZQ9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMOD4Q9NZQ9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMOD4Q9NZQ9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMOD4Q9NZQ9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMOD4Q9NZQ9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMOD4Q9NZQ9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMOD4Q9NZQ9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMOD4Q9NZQ9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMOD4Q9NZQ9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMOD4Q9NZQ9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TMOD4Q9NZQ9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMOD4Q9NZQ9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMOD4Q9NZQ9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMOD4Q9NZQ9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMOD4Q9NZQ9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMOD4Q9NZQ9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMOD4Q9NZQ9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMOD4Q9NZQ9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMOD4Q9NZQ9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMOD4Q9NZQ9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMOD4Q9NZQ9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMOD4Q9NZQ9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMOD4Q9NZQ9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMOD4Q9NZQ9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMOD4Q9NZQ9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMOD4Q9NZQ9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMOD4Q9NZQ9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TMOD4Q9NZQ9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMOD4Q9NZQ9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD4Q9NZQ9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD4Q9NZQ9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD4Q9NZQ9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD4Q9NZQ9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD4Q9NZQ9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMOD4Q9NZQ9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMOD4Q9NZQ9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMOD4Q9NZQ9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms