Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 NDUFS7-209ENST00000538929 630 ntTSL 417.96■□□□□ 0.473e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 INTS11-234ENST00000527383 668 ntTSL 317.72■□□□□ 0.433e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 DENND1B-208ENST00000477581 549 ntTSL 317.41■□□□□ 0.383e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.353e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 ARAP1-220ENST00000544958 473 ntTSL 317.1■□□□□ 0.333e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 RPS7-208ENST00000481006 5429 ntTSL 1 (best)17.08■□□□□ 0.333e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 NDUFS7-204ENST00000436115 2879 ntTSL 517.06■□□□□ 0.323e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.313e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.273e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.253e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 SLC38A10-207ENST00000542075 2903 ntTSL 216.62■□□□□ 0.253e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.243e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.243e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 ARAP1-210ENST00000465814 5612 ntTSL 216.37■□□□□ 0.213e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 NDUFS7-206ENST00000535382 3050 ntTSL 216.31■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 RPS7-202ENST00000403564 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 NDUFS7-214ENST00000545446 3089 ntTSL 215.44■□□□□ 0.063e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.063e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.023e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.013e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 ARAP1-211ENST00000495878 2758 ntTSL 1 (best)14.96□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 INTS11-213ENST00000467408 639 ntTSL 214.68□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 INTS11-245ENST00000533916 405 ntTSL 213.95□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 COA6-204ENST00000619305 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.343e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 ARAP1-205ENST00000426523 4066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.353e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 INTS11-212ENST00000462432 2863 ntTSL 1 (best)12.75□□□□□ -0.373e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 RPS7-203ENST00000406376 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.453e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 AC067930.1-201ENST00000517300 291 ntBASIC12.17□□□□□ -0.463e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 ARAP1-207ENST00000429686 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.543e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 CLCN7-207ENST00000564568 533 ntTSL 410.96□□□□□ -0.653e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 RPS7-204ENST00000407445 833 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.883e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.13e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.343e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.423e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.443e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.34□□□□□ -2.365e-57■■■■■ 31.8
AATFQ9NY61 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.475e-57■■■■■ 31.8
AATFQ9NY61 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.12e-6■■■■■ 31.8
AATFQ9NY61 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.942e-6■■■■■ 31.8
AATFQ9NY61 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.922e-6■■■■■ 31.8
AATFQ9NY61 LRRC75A-AS1-228ENST00000584141 564 ntTSL 222.41■■□□□ 1.185e-15■■■■■ 31.8
AATFQ9NY61 LRRC75A-AS1-219ENST00000578757 920 ntTSL 1 (best)15.78■□□□□ 0.125e-15■■■■■ 31.8
AATFQ9NY61 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.534e-6■■■■■ 31.7
AATFQ9NY61 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC6.48□□□□□ -1.371e-323■■■■■ 31.6
AATFQ9NY61 RPL4-214ENST00000567229 2003 ntTSL 514.16□□□□□ -0.148e-51■■■■■ 31.6
AATFQ9NY61 RPL4-215ENST00000568588 1864 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.258e-51■■■■■ 31.6
AATFQ9NY61 RPL4-217ENST00000569696 569 ntTSL 513.21□□□□□ -0.298e-51■■■■■ 31.6
AATFQ9NY61 RPL4-201ENST00000307961 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.448e-51■■■■■ 31.6
AATFQ9NY61 RPL4-210ENST00000566039 1099 ntTSL 210.74□□□□□ -0.698e-51■■■■■ 31.6
AATFQ9NY61 RPL4-203ENST00000561775 1396 ntTSL 59.28□□□□□ -0.928e-51■■■■■ 31.6
AATFQ9NY61 CNOT6L-207ENST00000515441 572 ntTSL 418.74■□□□□ 0.593e-6■■■■■ 31.6
AATFQ9NY61 CNOT6L-204ENST00000506166 781 ntTSL 213.28□□□□□ -0.283e-6■■■■■ 31.6
AATFQ9NY61 CNOT6L-202ENST00000504804 1925 ntTSL 56.79□□□□□ -1.323e-6■■■■■ 31.6
AATFQ9NY61 CNOT6L-206ENST00000512485 1890 ntTSL 56.66□□□□□ -1.343e-6■■■■■ 31.6
AATFQ9NY61 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.783e-6■■■■■ 31.6
AATFQ9NY61 RPL4-216ENST00000569438 565 ntTSL 517.55■□□□□ 0.49e-51■■■■■ 31.5
AATFQ9NY61 RPL4-212ENST00000566622 817 ntTSL 216.79■□□□□ 0.289e-51■■■■■ 31.5
AATFQ9NY61 RPL4-205ENST00000564439 582 ntTSL 312.98□□□□□ -0.339e-51■■■■■ 31.5
AATFQ9NY61 RPL4-202ENST00000561554 580 ntTSL 413.33□□□□□ -0.281e-50■■■■■ 31.4
AATFQ9NY61 RPL4-213ENST00000566624 819 ntTSL 213.21□□□□□ -0.291e-50■■■■■ 31.4
AATFQ9NY61 HSPA9-212ENST00000523929 780 ntTSL 417.34■□□□□ 0.373e-11■■■■■ 31.3
AATFQ9NY61 HSPA9-202ENST00000501917 275 ntTSL 33.25□□□□□ -1.893e-11■■■■■ 31.3
AATFQ9NY61 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 31.3
AATFQ9NY61 SEPT2-227ENST00000462147 576 ntTSL 430.14■■■□□ 2.421e-6■■■■■ 31.3
AATFQ9NY61 SEPT2-229ENST00000466211 584 ntTSL 328.42■■■□□ 2.141e-6■■■■■ 31.3
AATFQ9NY61 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.081e-6■■■■■ 31.3
AATFQ9NY61 SEPT2-243ENST00000494824 565 ntTSL 526.6■■□□□ 1.851e-6■■■■■ 31.3
AATFQ9NY61 SEPT2-231ENST00000469175 486 ntTSL 326.41■■□□□ 1.821e-6■■■■■ 31.3
AATFQ9NY61 ATF1-202ENST00000549612 568 ntTSL 523.88■■□□□ 1.412e-8■■■■■ 31.3
AATFQ9NY61 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.141e-6■■■■■ 31.3
AATFQ9NY61 SEPT2-242ENST00000492978 775 ntTSL 321.45■■□□□ 1.021e-6■■■■■ 31.3
AATFQ9NY61 SEPT2-213ENST00000428282 1005 ntTSL 321.45■■□□□ 1.021e-6■■■■■ 31.3
AATFQ9NY61 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.991e-6■■■■■ 31.3
AATFQ9NY61 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.781e-6■■■■■ 31.3
AATFQ9NY61 SEPT2-204ENST00000391973 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 31.3
AATFQ9NY61 SEPT2-201ENST00000360051 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 31.3
AATFQ9NY61 SEPT2-230ENST00000467971 571 ntTSL 212□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 31.3
AATFQ9NY61 SEPT2-206ENST00000402092 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 31.3
AATFQ9NY61 SEPT2-220ENST00000443492 558 ntTSL 56.96□□□□□ -1.31e-6■■■■■ 31.3
AATFQ9NY61 ATF1-205ENST00000552510 549 ntTSL 55.58□□□□□ -1.522e-8■■■■■ 31.3
AATFQ9NY61 SEPT2-228ENST00000464128 565 ntTSL 44.81□□□□□ -1.641e-6■■■■■ 31.3
AATFQ9NY61 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.27□□□□□ -2.052e-8■■■■■ 31.3
AATFQ9NY61 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.112e-8■■■■■ 31.3
AATFQ9NY61 NAMPT-209ENST00000484527 833 ntTSL 315.97■□□□□ 0.152e-7■■■■■ 31.3
AATFQ9NY61 SNHG26-201ENST00000415611 1099 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.444e-15■■■■■ 31.2
AATFQ9NY61 SNHG26-202ENST00000422542 1106 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.654e-15■■■■■ 31.2
AATFQ9NY61 SNHG26-203ENST00000432668 574 ntTSL 36.02□□□□□ -1.454e-15■■■■■ 31.2
AATFQ9NY61 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.17□□□□□ -2.384e-15■■■■■ 31.2
AATFQ9NY61 AP1G1-215ENST00000568327 1724 ntTSL 522.1■■□□□ 1.133e-26■■■■■ 31.2
AATFQ9NY61 AP1G1-208ENST00000565009 2494 ntTSL 515.8■□□□□ 0.123e-26■■■■■ 31.2
AATFQ9NY61 AP1G1-218ENST00000569748 4554 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.193e-26■■■■■ 31.2
AATFQ9NY61 AP1G1-202ENST00000393512 3593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.593e-26■■■■■ 31.2
AATFQ9NY61 AP1G1-201ENST00000299980 6969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.963e-26■■■■■ 31.2
AATFQ9NY61 AP1G1-211ENST00000565642 2794 ntTSL 57.2□□□□□ -1.263e-26■■■■■ 31.2
AATFQ9NY61 AP1G1-213ENST00000566179 562 ntTSL 51.95□□□□□ -2.13e-26■■■■■ 31.2
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