Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX07

TRNAU1AP, tRNA selenocysteine 1-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNAU1APQ9NX07 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRNAU1APQ9NX07 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms