Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW6

NMRK1, Nicotinamide riboside kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMRK1Q9NWW6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NMRK1Q9NWW6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NMRK1Q9NWW6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms