Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC3

SLC38A7, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A7Q9NVC3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC38A7Q9NVC3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms