Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM30AQ9NV96 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM30AQ9NV96 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM30AQ9NV96 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM30AQ9NV96 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM30AQ9NV96 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM30AQ9NV96 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM30AQ9NV96 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM30AQ9NV96 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM30AQ9NV96 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM30AQ9NV96 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM30AQ9NV96 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM30AQ9NV96 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM30AQ9NV96 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM30AQ9NV96 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM30AQ9NV96 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM30AQ9NV96 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM30AQ9NV96 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM30AQ9NV96 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM30AQ9NV96 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM30AQ9NV96 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM30AQ9NV96 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM30AQ9NV96 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM30AQ9NV96 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM30AQ9NV96 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM30AQ9NV96 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM30AQ9NV96 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM30AQ9NV96 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM30AQ9NV96 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM30AQ9NV96 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM30AQ9NV96 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM30AQ9NV96 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM30AQ9NV96 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM30AQ9NV96 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM30AQ9NV96 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM30AQ9NV96 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM30AQ9NV96 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM30AQ9NV96 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM30AQ9NV96 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM30AQ9NV96 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM30AQ9NV96 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM30AQ9NV96 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM30AQ9NV96 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMEM30AQ9NV96 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM30AQ9NV96 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM30AQ9NV96 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM30AQ9NV96 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM30AQ9NV96 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM30AQ9NV96 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM30AQ9NV96 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM30AQ9NV96 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM30AQ9NV96 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM30AQ9NV96 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM30AQ9NV96 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM30AQ9NV96 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM30AQ9NV96 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM30AQ9NV96 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM30AQ9NV96 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM30AQ9NV96 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM30AQ9NV96 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms