Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM140Q9NV12 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms