Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AP5S1Q9NUS5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms