Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOXD4L1Q9NU39 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
FOXD4L1Q9NU39 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms