Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3GQ9NS98 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3GQ9NS98 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms