Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS91

RAD18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD18Q9NS91 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD18Q9NS91 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD18Q9NS91 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD18Q9NS91 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD18Q9NS91 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD18Q9NS91 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD18Q9NS91 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD18Q9NS91 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD18Q9NS91 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD18Q9NS91 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD18Q9NS91 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD18Q9NS91 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD18Q9NS91 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD18Q9NS91 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD18Q9NS91 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD18Q9NS91 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD18Q9NS91 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD18Q9NS91 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD18Q9NS91 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD18Q9NS91 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD18Q9NS91 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD18Q9NS91 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD18Q9NS91 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD18Q9NS91 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD18Q9NS91 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD18Q9NS91 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD18Q9NS91 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD18Q9NS91 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD18Q9NS91 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD18Q9NS91 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD18Q9NS91 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD18Q9NS91 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD18Q9NS91 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD18Q9NS91 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD18Q9NS91 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD18Q9NS91 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms