Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BIN3Q9NQY0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms