Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ50

MRPL40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL40Q9NQ50 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL40Q9NQ50 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MRPL40Q9NQ50 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPL40Q9NQ50 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPL40Q9NQ50 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPL40Q9NQ50 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPL40Q9NQ50 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPL40Q9NQ50 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPL40Q9NQ50 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms