Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms