Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A4GALTQ9NPC4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms