Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA1

KCNMB3, Calcium-activated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB3Q9NPA1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNMB3Q9NPA1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNMB3Q9NPA1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNMB3Q9NPA1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNMB3Q9NPA1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNMB3Q9NPA1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNMB3Q9NPA1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNMB3Q9NPA1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNMB3Q9NPA1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNMB3Q9NPA1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNMB3Q9NPA1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNMB3Q9NPA1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNMB3Q9NPA1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNMB3Q9NPA1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNMB3Q9NPA1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNMB3Q9NPA1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNMB3Q9NPA1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNMB3Q9NPA1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNMB3Q9NPA1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNMB3Q9NPA1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNMB3Q9NPA1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNMB3Q9NPA1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNMB3Q9NPA1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNMB3Q9NPA1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNMB3Q9NPA1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNMB3Q9NPA1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNMB3Q9NPA1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNMB3Q9NPA1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNMB3Q9NPA1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNMB3Q9NPA1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNMB3Q9NPA1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNMB3Q9NPA1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNMB3Q9NPA1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNMB3Q9NPA1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNMB3Q9NPA1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNMB3Q9NPA1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNMB3Q9NPA1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNMB3Q9NPA1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNMB3Q9NPA1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNMB3Q9NPA1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNMB3Q9NPA1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNMB3Q9NPA1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNMB3Q9NPA1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNMB3Q9NPA1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNMB3Q9NPA1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNMB3Q9NPA1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNMB3Q9NPA1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNMB3Q9NPA1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNMB3Q9NPA1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNMB3Q9NPA1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNMB3Q9NPA1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNMB3Q9NPA1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNMB3Q9NPA1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNMB3Q9NPA1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNMB3Q9NPA1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNMB3Q9NPA1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNMB3Q9NPA1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNMB3Q9NPA1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNMB3Q9NPA1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KCNMB3Q9NPA1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KCNMB3Q9NPA1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms