Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPHS2Q9NP85 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.4 ms