Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP84

TNFRSF12A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 12A, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF12AQ9NP84 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF12AQ9NP84 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms