Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
RAB18Q9NP72 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms